טיפול בהומאופתיה קלאסית הוא תהליך שבו מותאמת באופן אישי תרופה הומאופתית הייחודית למטופל ומלווה תהליך ההחלמה במהלך מספר חודשים
המפגש הראשון מוקדש כולו לאבחון. אורכו כשעתיים שבמהלכן עוברים על ההסטוריה הרפואית והאישית ויורדים לפרטי פרטים של הרגלי התזונה ואורח החיים.
לאחר סיום המפגש, מתבצע ניתוח והצלבת הממצאים מול מאגרי נתונים קליניים ,תהליך שעשוי לקחת מספר ימים.
התרופה נבחרת תוך התייחסות למכלול גורמים: מצבו הבריאותי ורמת החיוניות, האופי ועולמו הרגשי , אורח החיים וההיבטים הפיזיים
.
בהמשך, אחת ל4-6 שבועות מתבצעים מפגשי מעקב שעל פיהם משנים בהתאם לצורך את מינון ורמת מיהול התרופה , מספר המפגשים משתנה ממטופל למטופל על פי מצבו.